El objetivo principal de este laboratorio es realizar investigaciones sobre la ecología de diferentes especies de aves marinas en el Perú y en otras partes del mundo. Asi mismo, la Unidad tiene la función de formar a estudiantes, orientar y asesorar a tesistas, y recibir a investigadores colaboradores nacionales e internacionales. También brindamos capacitación y asesoría para técnicas de monitoreo de aves marinas.